Norwegian Gedmatch DNA Matching

Hvem av dine treff på Gedmatch er også på facebook?

Noe som kan gjøre det lettere å komme i kontakt med disse personene, og samarbeide videre. Det finnes flere slike grupper, de tar for seg en bestemt region eller land.  feks: 

• Norge – Norwegian Gedmatch DNA Matching
• Sverige – Swedish DNA MatchFinder

Gruppene er internasjonale så skriv helst på engelsk. 

Før du starter må du ha overført data til Gedmatch, eller Gedmatch Genesis

Hva trenger du før du begynner?

1. Smør tålmodighets muskelen. Du MÅ følge bruksanvisningen til punkt og prikke.
2. Skaff deg Gedmatch konto, slik at du får en Gedmatch ID
3. Google konto – Du trenger ikke gmail adresse, men må være registret hos Google slik at du får tilgang til å laste ned regnearket senere
4. Du må ha PC eller Mac (Man kan ikke bruke nettbrett eller mobil)
   Nettleser som støttes er: Chrome, Firefox, Safari, Opera.
   • OBS OBS ikke Microsoft sin nettleser virker ikke
     
5. Meld deg inn i facebook gruppa:  Norwegian Gedmatch DNA Matching

Fremgangsmåte:

• Alt på listen ovenfor må være på plass. Har du ikke dette i orden – start forfra.
• Finn frem din Gedmatch ID, og ditt facebook navn.
• Svar på 3 spørsmål i spørreundersøkelse  – https://bit.ly/2IdjRdU
  1. Gedmatch/Gedmatch Genesis ID
  2. Ditt facebook navn
  3. Din status i gruppen (1. venter på godkjenning, 2. medlem fra før m nytt kit, 3. vet ikke)
• Vent minst 24 timer, slik at info kan legges inn i databasen. NB Ha tålmodighet !
• Logg på Gedmatch
  1. velg ‘One-to-Many’ matches
  2. vent til listen er ferdig generert. Det skal stå noe ala dette nederst under tabellen.
  3. Tast CTRL+A (for å velge alt på nettsiden), så CTRL+C for å kopiere (alt)
     

2000 matches (6000 – 2237 rows)Query time = 0.28 – Total Search time = 1.79 secondsMatches Excluded – Not Public: 228 – F1: 0 – No Link: 9 – Short Shared: 0 – Duplicate: 0

Fortsettelse: (Gjenta med jevne mellomrom)

• Last ned regneark – (trykk på knapp – Lag kopi) https://docs.google.com/spreadsheets/d/1tUzJ72JK5NkKRaRWMDAm10VU3FAq4G-l3or8_GvuHhU/copy
• Etter at regnearket har åpnet seg (du ser ett bilde). Før du gjøre noe som helst, lim inn data fra Gedmatch med å taste CTRL+V.  NB NB Viktig at du ikke klikker i regnearket før du gjør dette.
• Vent 5-10 min
• Når data dukker opp i regnearket gå til fane “Matches”. (Statuslinje øverst til høyre vil vise seg)
• Ta skjermbilde – helst utsnitt av ny treffliste
• Del bilde i – Norwegian Gedmatch DNA Matching –  “Tag” medlemmene som dukker opp

Gjenta fremgangsmåte «Fortsettelse» med jevne mellomrom (Månedlig/kvartalsvis)

“Check your Data” 

• En test du kan kjøre i regnearket, for å se om du kan starte.
• Legg inn din Gedmacth ID, ditt navn bør dukke under, dersom ikke.
• Ventet du 24t under punkt fjerde kulepunkt?
• Du må også vente med å laste ned regnearket til du er lagt inn i databasen. Du kan ikke vente 24 t og bruke regnearket pånytt. Du må vente med å hente kopi, som har deg innlagt

Dette dokumentet på Google disk

Klyngetriks i FamilyTreeDNA

Dine DNA-treff kan hjelpe deg, om du vet hvordan å bruke de. Ved å ha ett bevisst forhold til hvem av dine treff du har lenket inn i ditt tre kan du la disse jobbe for deg. Denne artikkelen viser noen tips i denne sammenheng. 

Dette er utdyping av en åpenbaring jeg nevnte på  Facebook Gruppen – «Norway DNA – Norges prosjektet FTDNA» 

Bakgrunn: Jeg hadde slurvet med oppfølging av min mors DNA treff på FamilyTreeDNA (ftDNA), og tenkte jeg skulle gjøre noe med det. Tanken var at siden jeg lekt litt med DNA Painter (DP), skulle jeg legge alle de treffene jeg hadde «løst» inn i DP. På min mors profil i ftDNA var det bare 1 person utenom min sønn og meg, som var lenket. Han er en firmenning (3C-third cousin). Hun har også treff på MyHeritage, og der hadde hun 2 jeg hadde funnet ut av. (Tremenning – 2C og 2C1R) 

Plukket først ut firmenning treffet i ftDNA, og skulle legge bare den inn, men startet på nytt fordi jeg fikk spørsmål om hvilken side kromosomene tilhørte. ftDNA har jo røde damer og blå menn. Tenkte derfor «hva om jeg legger inn alle som er faset på ftDNA?»

Treffene er anonymisert. Siden få personopplysninger avsløres kunne dette stått usladdet

Bare 18 personer er faset hos min mor, og bare på hennes mor’s side (Paternal=0, Maternal=18). Tenkte ikke noe videre på dette først, men dette er en del av observasjonen som følger

Siden DNA painter spør om hvilken side data kommer fra, tenkte jeg det er kjempesmart å plukke alle disse, og sette de på hennes morsside. Fordi poenget for meg er å se hvem andre som matcher oss, utelater derfor oss min sønn og meg, når jeg skal se videre på segmenter.

Via kromosonleseren får man tak i segmentene til DNA Painter

Man kan velge maks 7 personer

I kromosonleseren til ftDNA kan man filtrere på «maternal side» (morssiden). Prøvde å laste ned alle 18(-2) i utvalget, men fant ikke noen enkel måte å gjøre dette på. «Download all segments» er absolutt alle, uansett hvilken avgrensning man gjør på siden. Måtte derfor ta 7 og 7 om gangen (og tilslutt 2). se bilde under

Lastet ned segmentene til disse 14 til PC’en. DNA Painter har nå en funksjon å laste inn mange segmenter fra flere i en jafs. (Masse import). Hadde 3 filer, Det ble derfor 3 grupper i DP. Senere slo jeg sammen disse 3 gruppene til en gruppe, som jeg kalte «ftDNA Maternal Matches Runa Holte»

«Import data» takler segmenter fra 1 fil med flere personer i en jafs

Justerte segment nivå, før jeg valgte fil, og trykket import

View Group: Herfra kan jeg slå sammen grupper

I ftDNA listen dukket ett navn opp, men det var ikke noe tre. Mente jeg hadde sett dette navnet før, og kikket på MyHeritage. Digresjon: dette var ett hendig uhell, min mor har en tremenning med samme fornavn, men annet etternavn. Men fant også denne personen hos MyHeritage. Etter å ha sjekket smart match’ene,  fant jeg veldig raskt ut hvem felles ane var; samme anepar som jeg først jobbet med. Treffet blir mao firmenning forskjøvet ett ledd.

Sakte begynte ting å falle på plass for meg.

En lenket person, gav meg følgende:

ftDNA plukker ikke vilkårlig ut og faser hvem som tilhører hvilken side. Alle som match’er gitte kriterier, blir faset. De er alle antagelig i slekt (IBS – Identified by state). Med bare 1 person lenket vil andre som faser, tilhøre samme familieklynge (cluster). Alle tilhører samme samme slektslinje min mors tippoldeforeldre ligger på. Min (mors) mors mors fars foreldre. Dette vil være informasjon som en match trenger for å finne ut av ting på sin side, eller du trenger om du gjør mer slektsforskning på egenhånd.

OBS! Det er en sjanse for feil/avvik når man sammenligner data. Senere funn kan plukke noen ut av din familieklynge siden. Disse tilfeldige treff kalles (IBC – Identified by chance). 

Om jeg bare legger til folk i treet som tilhører denne gruppen vil jeg kunne finne flere biter av felles denne gruppens felles dna pool. Ved å være bevisst på hvem man har koblet inn i treet har man en enkel måte å klynge slekt på. «Fattigmanns klynge verktøy», bruk 1 lenket person til å bygge denne personens familieklynge.

Lenker man til flere personer, vil dette kunne endre hvem som faser. De på samme side, vil bidra til å avdekke opp hvilke segmenter min mor har fått på den siden. DNA Painter visualiserer hvilke områder som blir avdekket. På den måten kan jeg vite hvilke mer om hvordan hennes dna er faset. Noe som igjen kan brukes til å rekonstruere biter av forefedres dna. Målet er å dele alt DNA inn ente far og mors side.

Verdt å merke seg:

Om du lenker ikke flere matcher, vil du etterhvert se at noen blir lilla. Dette er personer som kan være i slekt med både din mor og far. Disse bør du ikke bruke når du kartlegge videre. 

Bruker man alle i trefflisten i DNA Painter, men ikke de som er nære (kutt de med mer enn 1500 centimorgen), ser man hvor stor grad det teoretisk er mulig å fase/rekonstruere dna. Det vil alltid komme flere til, jo flere som tester seg jo bedre dekning kan man få.

Alle mine mors ftDNA treff. Bilde viser potensielet for å visuelt kartlegge hennes dna